科技大楼
中心所在的蒙民伟科技大楼位于清华大学校园东侧,于2013年投入使用。从中心位于十楼的实验室可鸟瞰清华大学校园全景,天气晴朗时可眺望北京西山一带的风景。
实验室
中心配置了有机合成实验室,仪器分析实验室,物理有机实验室,化学生物学实验室等,并配有先进的科研仪器设备,可为有机化学相关学科的研究提供一流水平的技术平台。